北交所不包括老三板，老三板作为退市板块，目前归属于新三板体系的一部分，这是理解中国多层次资本市场结构的关键点。
北京证券交易所（北交所）成立于2021年，是国务院批准的首家公司制证券交易所，定位为场内市场，主要服务于创新型中小企业上市融资；它由原新三板的精选层平移而来，专注于提供正规的股票交易平台，与老三板无直接隶属关系，这从历史演变中可以看出其独立性。
新三板（全国中小企业股份转让系统）则是一个场外市场，包括基础层、创新层以及老三板（即两网及退市股票板块），老三板负责承接从沪深交易所退市的股票和原两网市场遗留问题，确保退市企业仍有交易渠道；新三板作为整体，充当中小企业练兵场，老三板是其不可或缺的子模块，而非北交所的组成部分。
老三板的核心功能是处理退市公司股票交易，投资者若持有退市股票，可直接在该板块卖出，无需额外权限；但北交所的股票交易需满足资产和风险承受门槛，两者在交易规则上差异显著，例如北交所实施30%涨跌幅限制，而老三板在新三板体系下采用特定撮合机制，进一步凸显了它们的分离性。
两者的区别还体现在市场层级和准入条件上：北交所要求创新层企业挂牌满12个月才可上市，而老三板作为新三板的退市板块，开通权限需日均资产50万元；这种设计分层管理风险，北交所聚焦上市企业流动性，老三板则处理尾部风险，确保资本市场健康运行。
